1、见效慢：通过网站优化获得排名是无法速成的，一般难度的词大约需要2-3个月的时间，如果难度更大的词则需要4-5个月甚至更久，建议企业可以在销售淡季进行网站优化工作，到了销售旺季时排名也基本稳定了。
2、排名规则的不确定性：由于搜索引擎对排名有各自的不同规则，有可能在某天某个搜索引擎对排名规则进行了改变，那时也许就会出现原有的排名位置发生变动，这个是很正常的现象，届时我们将会以最快的速度研究最新的规则，将网站重新恢复排名。
3、关键词区分难易程度：竞争过于火爆的关键词，例如：手机、电脑等，做优化排名难度是很大的，这需要非常长久的时间，而且价格也会非常高昂，所以难度太大的词不适合做优化。
4、关键词数量有限：做网站独立优化一个网站页面推荐只做一个关键词，最多不超过3-4个，其中1-2个是主词，剩余1-2个是分词，做不到竞价排名那种想做多少做多少的效果。
5、排名位置在竞价排名之后：这个是由百度的规则决定的，英文优化自然排名所在的位置只能在竞价排名的网站之后。